Руководство текущей деятельностью ООО НКО «Мобильная карта» осуществляется единоличным исполнительным органом — Председателем Правления и коллегиальным исполнительным органом — Правлением. Исполнительные органы подотчетны Общему собранию участников и Совету директоров.